По итогам анализа выполнения условий лицензионных соглашений за 2005 года структурами, входящими в состав "Газпромнефть", инспекторы Росприроднадзора пришли к выводу, что компания значительно отклонилась от установленных показателей по целому ряду геологических работ, а также по объемам добычи углеводородного сырья.
Всего дочерним компаниям "Газпромнефть", среди которых «Заполярнефть», «Меретояханефтегаз», «Сибнефть-Югра», «Сибнефть», «Сибнефть-Ноябрьскнефтегаз», «Сибнефть-Чукотка», принадлежит более 50 лицензий на поиск, разведку и добычу УВС. В настоящее время, по сообщению специалистов Росприроднадзора, компания «Газпромнефть» не выполняет лицензионные соглашения по следующим параметрам: поисковое оценочное бурение, сейсморазведка, добыча нефти и добыча свободного газа. Росприроднадзор также располагает информацией о нарушениях природоохранного законодательства, допущенных дочерними компаниями "Газпромнефти" при поиске и добыче нефти. В частности «Меретояханефтегаз» и «Сибнефть-Чукотка» не выполнили условия по поисковому оценочному бурению за 2005 год на 100%. А компания «Сибнефть-Югра» значительно отклонилась от установленного объема работ по сейсморазведке. «Сибнефть-Чукотка» добыла свободного газа на 25% меньше планового показателя.
Росприроднадзор объявил о том, что сформирует весь пакет документов, необходимый для проведения комплексной проверки выполнения требований природоохранного законодательства и условий лицензионных соглашений компании "Газпромнефть", которая начнется 21 ноября 2006 года. А заместитель руководителя Росприроднадзора Олег Митволь также подготовил запрос в Федеральную налоговую службу о предоставлении данных по платежам за пользование недрами по 48 лицензиям "Газпромнефти".